En 1787, la suerte de Mozart estaba cayendo en espiral. El compositor de 31 años enfrentó varias crisis: enfermedad, deudas crecientes y la desalentadora comprensión de que los Vieneses, cinco años después de la llegada de Mozart a esa ciudad, se cansaron de él. En el verano de 1788, el compositor afligido por la pobreza escribió una serie de cartas desesperadas a su amigo Michael Puchberg, pidiendo préstamos. Mozart también empeñó varios objetos de valor, trató de obtener anticipos de su editor e intentó vender sus manuscritos; estos esfuerzos humillantes rindieron poco.
Las últimas tres sinfonías de Mozart, núms. 39, 40 y 41, se compusieron en nueve semanas durante el verano de 1788. Incluso para Mozart, este ritmo de producción es notable, especialmente dada la alta calidad de las tres obras. Probablemente Mozart las escribió para una serie de conciertos que planeaba presentar en Viena a finales de ese verano, o para un viaje a Londres (que finalmente nunca hizo), o quizás ambos. No hay documentación sobreviviente sobre los estrenos de estas sinfonías, pero la velocidad a la que Mozart las compuso sugiere una necesidad urgente de nueva música que atraiga al público a la sala de conciertos.
Mozart no le dio a su sinfonía final el apodo de "Júpiter". Los comentarios atribuidos al hijo de Mozart, Franz Xavier, en 1829, sugieren que el músico / empresario Johann Peter Salomon primero le dio el sobrenombre de "Júpiter" a la sinfonía en Do mayor. Independientemente de cómo el nombre se adhiera a esta música, captura perfectamente el carácter noble y las cualidades del dios romano Júpiter. En Andante, Mozart se aparta del optimista Do mayor de la apertura con una serie de secuencias anhelantes en las cuerdas que se transforman en armonías exóticas y distantes. En el glorioso final, (sobre el cual amantes de la música, eruditos y críticos han estado buscando en vano los adjetivos adecuados para describir su perfección durante más de dos siglos), Mozart combina el denso contrapunto barroco con un fraseo clásico cristalino. El difunto crítico de música Michael Steinberg calificó acertadamente a este movimiento como "una de las manifestaciones más espléndidas de esa rica reunión que llamamos estilo clásico". La Sinfonía "Júpiter" se erige como el mayor logro sinfónico de Mozart y ha alcanzado la inmortalidad del dios cuyo nombre lleva.